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          細胞自噬的研究方法介紹!

          發布時間: 2020-02-20   

          一、自噬誘導劑  

          (1) Bredeldin A / Thapsigargin / Tunicamycin :模擬內質網應激

          (2) Carbamazepine/ L-690,330/ Lithium Chloride(氯化鋰):IMPase抑制劑(即Inositol monophosphatase,肌醇單磷酸酶)

          (3) Earle's平衡鹽溶液:制造饑餓

          (4) N-Acetyl-D-sphingosine(C2-ceramide):Class I PI3K Pathway抑制劑

          (5) Rapamycin:mTOR抑制劑

          (6) Xestospongin B/C:IP3R阻滯劑

           

          二、自噬抑制劑  

          (1) 3-Methyladenine(3-MA):(Class III PI3K) hVps34 抑制劑

          (2) Bafilomycin A1:質子泵抑制劑

          (3) Hydroxychloroquine(羥氯喹):Lysosomal lumen alkalizer(溶酶體腔堿化劑)

          除了選用上述工具藥外,一般還需結合遺傳學技術對自噬相關基因進行干預:包括反義RNA干擾技術(Knockdown)、突變株篩選、外源基因導入等。

           

          三、自噬過程進行觀察和檢測 

          細胞經誘導或抑制后,需對自噬過程進行觀察和檢測,常用的策略和技術有:

          1、觀察自噬體的形成

          由于自噬體屬于亞細胞結構,普通光鏡下看不到,因此,直接觀察自噬體需在透射電鏡下。phagophore的特征為:新月狀或杯狀,雙層或多層膜,有包繞胞漿成分的趨勢。自噬體(**1)的特征為:雙層或多層膜的液泡狀結構,內含胞漿成分,如線粒體、內質網、核糖體等。自噬溶酶體(**2)的特征為:單層膜,胞漿成分已降解。(autophagic vacuole,**)

          2、在熒光顯微鏡下采用GFP-LC3融合蛋白來示蹤自噬形成

          由于電鏡耗時長,不利于監測(Monitoring)自噬形成,人們利用LC3在自噬形成過程中發生聚集的現象開發出了此技術。無自噬時,GFP-LC3融合蛋白彌散在胞漿中;自噬形成時,GFP-LC3融合蛋白轉位至自噬體膜,在熒光顯微鏡下形成多個明亮的綠色熒光斑點,一個斑點相當于一個自噬體,可以通過計數來評價自噬活性的高低。

          3、利用Western Blot檢測LC3-II/I比值的變化以評價自噬形成

          自噬形成時,胞漿型LC3(即LC3-I)會酶解掉一小段多肽,轉變為(自噬體)膜型(即LC3-II),因此,LC3-II/I比值的大小可估計自噬水平的高低。

          (注意:LC3抗體對LC3-II有更高的親和力,會造成假陽性。方法2和3需結合使用,同時需考慮溶酶體活性的影響。)

          4、檢測長壽蛋白的批量降解:非特異

          5、MDC(Monodansylcadaverine,單丹磺酰尸胺)染色:包括自噬體,所有酸性液泡都被染色,故屬于非特異性的。

          6、CellTrackerTM Green染色:主要用于雙染色,但其能染所有的液泡,故也屬于非特異性的。

           

          四、自噬相關蛋白的定位 

          在研究自噬相關蛋白時,需對其進行定位。由于自噬體與溶酶體、線粒體、內質網、高爾基體關系密切,為了區別,常用到一些示蹤蛋白在熒光顯微鏡下來共定位:

          Lamp-2:溶酶體膜蛋白,可用于監測自噬體與溶酶體融合。

          LysoTrackerTM 探針:有紅或藍色可選,顯示所有酸性液泡。

          pDsRed2-mito:載體,轉染后表達一個融合蛋白(紅色熒光蛋白+線粒體基質定位信號),可用來檢測線粒體被自噬掉的程度(Mitophagy)。

          MitoTraker探針:特異性顯示活的線粒體,熒光在經過固定后還能保留。

          Hsp60:定位與線粒體基質,細胞死亡時不會被釋放。

          Calreticulin(鈣網織蛋白):內質網腔

          (注意:這些蛋白均為胞漿蛋白,爬片或胰酶消化的細胞在做免疫熒光前需先透膜(permeablize),可采用0.1%SDS處理。)

           


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